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苹果短信全部已读但仍显示红色数字，可能是由于以下几个原因造成的。
1、软件错误或系统bug：这可能是短信应用中的一个小错误或系统bug，尝试重启设备或更新操作系统和短信应用至最新版本，看是否能解决问题。
2、未删除的短信：红色数字提示可能是因为还有未删除的短信，即使这些短信已经读过了，确保进入短信应用并仔细检查是否有未删除的短信或未处理的通知。
3、通知设置问题：检查通知设置，确保短信应用的通知功能已开启，并且选择了正确的提示方式，即使短信已读，但如果通知设置不正确，仍然会显示红色数字。
4、第三方应用干扰：某些第三方应用可能会与短信应用产生冲突，导致显示异常，尝试暂时关闭或卸载最近安装的应用，看是否能解决问题。
如果以上方法均无效，建议联系苹果官方客服或前往附近的苹果专卖店寻求帮助，他们可能能提供更专业的解决方案。